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對于沙門氏菌檢測基因組工具成為關(guān)鍵

發(fā)布時間:2019-07-29瀏覽次數(shù):1358返回列表

紐約ITHACA - 食品供應(yīng)將變得更加安全,因為食品行業(yè)轉(zhuǎn)向高分辨率,全基因組測序 - 同時檢測特定生物體的完整DNA。這種使測序無處不在的舉措將導(dǎo)致始終如一地可靠地檢測沙門氏菌。

由康奈爾大學(xué)和火星食品安全中心(GFSC)的研究人員共同撰寫的一篇發(fā)表在“微生物學(xué)前沿”雜志上的論文闡明了突破。

“沙門氏菌是公共衛(wèi)生和經(jīng)濟影響Z大的食源性病原體。它是各地腹瀉的主要原因之一,”食品安全教授兼康奈爾食品系統(tǒng)研究所教授Martin Wiedmann說。“沙門氏菌可能是輕微的,也可能導(dǎo)致死亡,因為它的嚴(yán)重程度取決于沙門氏菌的血清型[不同的變異] - 而這正是我們試圖找到的?!?

該論文描述了各地的食品工業(yè)應(yīng)如何更頻繁地使用分子方法來分類和表征沙門氏菌。本文將舊的亞型實踐 - 一些可追溯到20世紀(jì)30年代的實踐 - 與較新的全基因組測序進行了比較,這種方法可以分析更廣泛,更完整的基因組區(qū)域。

Wiedmann說,通過這種技術(shù),科學(xué)家可以更準(zhǔn)確地識別特定的沙門氏菌菌株,并確定疾病爆發(fā)的起源和途徑。

例如,7月初美國食品和藥物管理局和聯(lián)邦疾病控制和預(yù)防中心(CDC)使用該技術(shù),因為他們開始調(diào)查豬耳狗和人類之間的可疑沙門氏菌鏈接 - 由于人們處理對待。根據(jù)疾病預(yù)防控制中心的數(shù)據(jù),當(dāng)時有13個州有45例沙門氏菌病例,其中有12人住院治療。

“全基因組測序正迅速成為沙門氏菌亞型選擇的xuan方法,”該論文的主要作者,火星食品安全中心的研究科學(xué)家Silin Tang說?!笆称方?jīng)常通過日益復(fù)雜的供應(yīng)鏈接觸消費者,創(chuàng)造了許多食品安全可能受到損害的機會。Z近的案例強調(diào)了加強食品行業(yè)中沙門氏菌控制措施的必要性,包括使用適當(dāng)?shù)膩喰凸ぞ呖焖贉?zhǔn)確地跟蹤污染源。 “

唐說,食品行業(yè)有機會創(chuàng)建生物信息學(xué)專業(yè)人才管道 - 利用軟件工具來理解生物數(shù)據(jù) - 利用全基因組測序技術(shù)的全部潛力。

此外,Wiedmann說,本文將學(xué)術(shù)分析轉(zhuǎn)化為有用的行業(yè)應(yīng)用。“這將有助于工業(yè)實施更好的方法來主動解決沙門氏菌的并發(fā)癥和復(fù)雜性,”他說。

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